ภารกิจ
สำนักงานปลัดบัญชีทหารอากาศ ซึ่งเป็นส่วนราชการขึ้นตรงกองทัพอากาศตามพระราชกฤษฎีกา แบ่งส่วนราชการและกำหนดหน้าที่ของส่วนราชการ กองทัพอากาศ กองบัญชาการทหารสูงสุด กระทรวงกลาโหม พ.ศ.๒๕๒๑ มีหน้าที่วางแผน ประสานงาน กำการ ควบคุม ศึกษา วิจัย พัฒนา เสนอแนะ และดำเนินการเกี่ยวกับการบริหารทรัพยากร การงบประมาณ การเงิน การบัญชี การตรวจบัญชี การวิเคราะห์การจัดดำเนินงานและการสถิติของกองทัพอากาศ ตลอดจนควบคุมตรวจตรากิจการในสายวิทยาการปลัดบัญชี โดยมีหน่วยขึ้นตรง คือ แผนกธุรการ กองงบประมาณ กองบัญชี กองตรวจบัญชี กองตรวจสอบและวิเคราะห์ และกองจัดการ
ได้มีพระราชกฤษฎีกาแบ่งส่วนราชการและกำหนดหน้าที่ของส่วนราชการกองทัพอากาศ กองบัญชาการทหารสูงสุด กระทรวงกลาโหม พ.ศ.๒๕๒๙ กำหนดให้สำนักงานตรวจบัญชีทหารอากาศเป็นส่วนราชการขึ้นตรงกองทัพอากาศ การจัดตั้งสำนักงานตรวจบัญชีทหารอากาศ ดำเนินการควบคู่ไปกับการยุบ กองตรวจบัญชี สำนักงานปลัดบัญชีทหารอากาศ โดยโอนอัตรามากำหนดรวมกับอัตราสำนักงานตรวจบัญชีทหารอากาศ ทำให้สำนักงานปลัดบัญชีทหารอากาศ มีหน่วยขึ้นตรง คือ แผนกธุรการ กองงบประมาณ กองบัญชี กองตรวจสอบและวิเคราะห์ และกองจัดการ
รัฐมนตรีว่าการกระทรวงกลาโหม ได้อนุมัติหลักการเมื่อ ๓ ตุลาคม พ.ศ.๒๕๓๘ ให้จัดตั้งกองบริหารทรัพยากรในระดับสำนักงานปลัดบัญชีเหล่าทัพ เพื่อให้เป็นหน่วยรองรับการดำเนินการตาม รผกง.และรัฐมนตรีว่าการกระทรวงกลาโหม ได้อนุมัติให้จัดตั้ง กองบริหารทรัพยากร สำนักงานปลัดบัญชีทหารอากาศ เมื่อ ๖ กันยายน พ.ศ.๒๕๓๙
สำนักงานปลัดบัญชีทหารอากาศ มีหน้าที่วางแผน อำนวยการ ประสานงาน กำกับการ ควบคุม เสนอแนะ และดำเนินการเกี่ยวกับการบริหารทรัพยากร การงบประมาณ การเงิน การบัญชี การตรวจบัญชี การจัดดำเนินงาน การวิเคราะห์ การสถิติ และการประสานกรรมวิธีข้อมูลด้านงบประมาณของกองทัพอากาศ กับมีหน้าที่กำหนดแนวทาง ควบคุมและประเมินผลเกี่ยวกับการฝึกศึกษา และการตรวจตรากิจการในสายวิทยาการด้านปลัดบัญชี มีปลัดบัญชีทหารอากาศ เป็นผู้บังคับบัญชารับผิดชอบ